空间产品
通过采用尖端的空间技术,能够在保持细胞原始空间位置的同时,精确分析和可视化基因表达和蛋白标记等,深入研究组织微环境中的细胞互作。
10x Genomics空间转录组(含Visium HD)
将基因空间表达可视化,在识别不同细胞群的同时保留空间背景,提供了关于组织微环境中细胞功能、表型和位置关系的关键信息。
Stereo-seq空间转录组
该技术通过时空芯片捕获组织中的 mRNA,并通过空间条形码(Coordinate ID,CID)还原回空间位置实现组织原位测序,为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。
Akoya空间蛋白组
可提供同时检测几种(PhenoImager Fusion)到100多种(PhenoCycler-Fusion)生物蛋白标志物的解决方案,准确定位细胞空间分布、判断细胞行为、识别不同的细胞聚集模式,实现组织原位超多靶点蛋白标记分析。
应用方向
- 肿瘤及免疫研究:有助于识别肿瘤微环境中的细胞相互作用,以及免疫细胞在肿瘤进展和治疗反应中的角色;
- 病理学研究:通过在组织切片上进行高分辨率的分子表达分析,有助于揭示疾病的分子机制和组织中的病理变化;
- 发育生物学:通过分析发育过程中细胞在空间上的分布和基因表达变化,揭示细胞分化和组织形态形成的动态过程;
- 空间图谱:构建器官和组织的空间图谱,展示细胞在特定生理和病理状态下的空间分布和相互作用,这对于理解复杂生物系统的结构和功能至关重要;
- 生物标志物挖掘:通过分析细胞在特定组织环境中的表达模式,可以识别与疾病进程、治疗响应或预后相关的关键分子标志物;
案例解析

头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)肿瘤微环境空间激活途径
单细胞联合空间转录组揭示头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中增殖型耗竭CD8+T细胞作用
该研究利用单细胞水平的多组学技术构建了人头颈鳞状细胞癌的多维度肿瘤微环境图谱,从中鉴定出了一群具有增殖潜能并能持续发挥抗瘤效应的新增殖型耗竭CD8+T细胞,并深入解析了其在肿瘤微环境中的作用机制。本研究系统性地解析了头颈鳞状细胞癌微环境中增殖型耗蝎CDB+T细胞的多维度特征,证实了其丰度与HPV阳性头颈鲜状细胞癌患者预后间的关联性,以耗竭CD8+T细胞异质性为切入点,为HPV感染状态如何影响CDK4抑制剂对头颈鲜状细胞癌的疗效提供了新的解释,有助于推动头颈鲜状细胞癌精准治疗的进一步发展。
参考文献:Cheng D, Qiu K,Rao Y. et al. Proliferative exhausted CD8+ T cells exacerbate long-lasting anti-tumor effects in human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma [J]. Elife. 2023 Feb 22:12:e82705.